NIBSC 06/202 人乳頭瘤病毒16 型標(biāo)準(zhǔn)品
簡(jiǎn)要描述:NIBSC 06/202 人乳頭瘤病毒16 型標(biāo)準(zhǔn)品用于 HPV 16 型 (HPV16) DNA 的第一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)基于核酸的測(cè)定由冷凍干燥的制備物組成含有全長(zhǎng) HPV16 DNA 的重組質(zhì)粒 pBR322 被克隆通過(guò)其*的 BamH1 站點(diǎn) (Quint et al., 2006)
所屬分類:NIBSC標(biāo)準(zhǔn)品
更新時(shí)間:2022-04-21
廠商性質(zhì):經(jīng)銷商
品牌 | NIBSC | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè) |
1. 預(yù)期用途
用于 HPV 16 型 (HPV16) DNA 的第一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)基于核酸的測(cè)定由冷凍干燥的制備物組成含有全長(zhǎng) HPV16 DNA 的重組質(zhì)粒 pBR322 被克隆通過(guò)其*的 BamH1 站點(diǎn) (Quint et al., 2006)。該標(biāo)準(zhǔn)已在純化的人類基因組 DNA 的背景下配制,凍干在 0.5 ml 等分試樣中并儲(chǔ)存在 -20 °C。材料經(jīng)過(guò)校準(zhǔn)涉及 19 個(gè)實(shí)驗(yàn)室的國(guó)際合作研究(Wilkinson 等人,2010)。國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)包含的材料是專有的第三方,應(yīng)僅用于內(nèi)部校準(zhǔn)或HPV-16擴(kuò)增檢測(cè)的工作標(biāo)準(zhǔn)脫氧核糖核酸。國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)不應(yīng)用于任何其他用途,使用后應(yīng)丟棄。
2. 注意
NIBSC 06/202 人乳頭瘤病毒16 型標(biāo)準(zhǔn)品 不適用于人類食物鏈中的人類或動(dòng)物。
該材料含有源自 C33A 細(xì)胞的 DNA。與所有生物來(lái)源的材料一樣,這種制劑應(yīng)被視為對(duì)健康有潛在危害。應(yīng)根據(jù)您自己實(shí)驗(yàn)室的安全程序使用和丟棄它。此類安全程序應(yīng)包括戴防護(hù)手套和避免產(chǎn)生氣溶膠。打開(kāi)安瓿或小瓶時(shí)應(yīng)小心謹(jǐn)慎,以免割傷。
3. 單元
HPV16 DNA 的第一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)(NIBSC 代碼 06/202)已規(guī)定為每安瓿 5 x 10^6 國(guó)際單位 (IU) 的單位。
可追溯性聲明:
在 2008 年 1 月的一次 WHO 會(huì)議上(WHO 會(huì)議報(bào)告,2008 年)提出,HPV16 DNA 國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的使用說(shuō)明包括用于確定所用散裝材料的理論 HPV16 基因組當(dāng)量 (GEq) 的計(jì)算和假設(shè)在制定國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)時(shí),證明 1 IU 相當(dāng)于 1 GEq 用于 HPV16 DNA。因此,第一個(gè) WHO HPV16 DNA 國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的最終統(tǒng)一仍然是 IU,而可追溯性聲明將允許用戶將 IU 等同于 GEq。
在新墨西哥大學(xué) (UNM) 的 Cosette Wheeler 博士的實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行了重組 HPV16 質(zhì)粒儲(chǔ)備制劑的 DNA 濃度測(cè)定。 DNA濃度通過(guò)260 nm處的吸光度以及使用Picogreen測(cè)定法(Invitrogen Corporation,USA)的分光熒光法測(cè)定。在兩次 DNA 測(cè)量之間獲得了 0.95 或更高的相關(guān)系數(shù)。將 10 ng HPV16 質(zhì)粒 DNA/μl 提供給 NIBSC 用于配制用于隨后冷凍干燥的散裝材料。 UNM 實(shí)驗(yàn)室還向 NIBSC 提供了一份聲明,表明 HPV16 的 1.0 x 1011 GEq/ml 等于 1.17 ng/μl。因此,10 ng HPV-16 質(zhì)粒 DNA/μl 質(zhì)粒儲(chǔ)備液相當(dāng)于 8.547 x 1011 HPV-16GEq/ml。 NIBSC 在制定第一國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)時(shí)使用了這些數(shù)據(jù)用于 HPV 16 型 DNA。
用于 HPV 16 型 DNA 的第一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)(NIBSC 代碼 06/202)的散裝材料配方:
在 NIBSC,根據(jù)公式制備大量 HPV16 質(zhì)粒 DNA 材料:
HPV GEq/ml 散裝材料 = (HPV GEq/ml 質(zhì)粒原液 x 體積質(zhì)粒原液)/體積散裝材料。因此,HPV16 GEq/ml 散裝材料 = (8.547 x 1011 HPV-16 GEq/ml 質(zhì)粒原液)x(0.02223 ml HPV-16 質(zhì)粒原液)/1900 ml HPV-16 散裝材料 = 1.0 x 107 HPV-16 GEq/ml散裝材料 HPV-16 DNA 散裝材料隨后以 0.5 ml 等分試樣冷凍干燥。第一次將 IU 等同于 GEq 需要某些假設(shè)HPV16 DNA 的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn):
1) HPV16 的 1.0 x 1011 GEq/ml 等于 1.17 ng/μl。
2) 凍干后 HPV16 DNA 的活性沒(méi)有損失。
3) 重組HPV-16質(zhì)粒DNA準(zhǔn)確模擬了生物樣本中HPV16病毒DNA的活性。
獨(dú)立計(jì)算重組 HPV-16 質(zhì)粒的 GEq/ml脫氧核糖核酸。
NIBSC 還使用 BioEdit 序列比對(duì)編輯器 v7.0.5.3 (Tom Hall, Isis 制藥公司,美國(guó))。用于確定分子量的序列是用于 pBR322 的 GenBank 登錄號(hào) J01749.1 和用于 HPV16 的參考序列(登錄號(hào) K02718)。
生物編輯數(shù)據(jù)DNA分子:HPV16 Accession K02718
長(zhǎng)度 = 7904 個(gè)堿基對(duì)
MW= 4786756.00 道爾頓,雙鏈
DNA分子:克隆載體pBR322
長(zhǎng)度 = 4361 個(gè)堿基對(duì)
MW= 2653867.00 道爾頓,雙鏈
公式 HPV 質(zhì)粒原液的 GEq/ml 根據(jù)公式計(jì)算:
HPV 質(zhì)粒原液的 GEq/ml = (HPV 質(zhì)粒原液的 DNA 濃度) x (HPV DNA 的 MW + pBR322 的 MW)-1 x (阿伏伽德羅數(shù)) 其中阿伏伽德羅數(shù) = 6.022x1023 分子/mol
根據(jù)以下公式計(jì)算大量 HPV DNA 材料的 GEq/ml:
HPV GEq/ml 散裝材料 = (HPV GEq/ml 質(zhì)粒原液 x 體積質(zhì)粒原液)/體積散裝材料。計(jì)算 將重組 HPV16 質(zhì)粒原液以 10 ng/μl 的濃度提供給 NIBSC。
使用上面顯示的 MW 測(cè)定,HPV16 質(zhì)粒原液的 GEq/ml 為:
= (10 x 10-9g/μl) x (mol/(7440623 g) x (6.022x1023 分子/mol)
= 8.093 x 108 分子/μl
= 8.093 x 1011 分子/毫升
= 8.093 x 1011
HPV16 GEq/ml
將 22.23μl 重組 HPV16 質(zhì)粒原液稀釋至終體積為 1900ml,因此,HPV-16 GEq/ml 散裝材料 = (8.093 x 1011 HPV16 GEq/ml 質(zhì)粒原液) x (0.02223 ml HPV16 質(zhì)粒原液) / 1900 ml HPV16 散裝材料 = 0.947 x 107 HPV16 GEq/ml 散裝材料
4. 內(nèi)容
生物材料原產(chǎn)國(guó):英國(guó)。
每個(gè)安瓿含有相當(dāng)于 0.5 ml HPV16 的凍干粉
質(zhì)粒 DNA 在 10mM Tris 緩沖液 pH7.4 中含有 1mM EDTA、5 mg/ml 海藻糖和 ~1 x 106 人 Geq/ml 源自 C33a 細(xì)胞。
5. 存儲(chǔ)
NIBSC 06/202 人乳頭瘤病毒16 型標(biāo)準(zhǔn)品 收到時(shí),安瓿瓶應(yīng)存放在 -20 °C 或以下。
請(qǐng)注意:由于凍干材料固有的穩(wěn)定性,NIBSC 可能會(huì)在環(huán)境溫度下運(yùn)輸這些材料。
6. 開(kāi)瓶指南
DIN 安瓿瓶有一個(gè)“易開(kāi)"顏色的壓力點(diǎn),窄的安瓿桿在此與較寬的安瓿瓶主體相連。各種類型安瓿破膠劑是市售的。打開(kāi)
安瓿,輕輕敲擊安瓿以收集底部(標(biāo)記)端的材料,并按照安瓿破碎機(jī)提供的制造商說(shuō)明進(jìn)行操作。
7. 材料的使用
在重新配制之前,不應(yīng)嘗試稱量?jī)龈刹牧系娜魏尾糠帧?/span>
HPV16 DNA 的第一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)包含高拷貝數(shù)模板。 HPV16質(zhì)粒的風(fēng)險(xiǎn)很高。打開(kāi)玻璃安瓿時(shí)通過(guò)霧化造成 DNA 污染。材料必須在單獨(dú)的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中打開(kāi)和處理,遠(yuǎn)離試劑、實(shí)驗(yàn)室器具和樣品等其他預(yù)放大組件。該材料以凍干形式提供,使用前應(yīng)在 0.5 ml 無(wú)菌無(wú)核酸酶水中復(fù)溶。確保安瓿的內(nèi)表面被添加的水潤(rùn)濕,以便重組粘附在玻璃上的任何凍干材料顆粒。重組材料的最終濃度為 1 X 10^7 IU/mL。重組材料適用于校準(zhǔn)內(nèi)部或工作標(biāo)準(zhǔn),以擴(kuò)增和檢測(cè) HPV16 DNA。該材料不適用于校準(zhǔn)或評(píng)估提取、沉淀或離心程序。 NIBSC 可以為在提取步驟無(wú)法與擴(kuò)增步驟分離的分析中使用 HPV16 DNA 國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)(例如進(jìn)樣、應(yīng)答平臺(tái))提供指導(dǎo)。該材料未針對(duì)人類 DNA 核酸擴(kuò)增技術(shù)進(jìn)行校準(zhǔn)。