NIBSC 06/206 人乳頭瘤病毒18 型標(biāo)準(zhǔn)品
簡要描述:NIBSC 06/206 人乳頭瘤病毒18 型標(biāo)準(zhǔn)品用于核酸檢測的第一個(gè) HPV 18 型 (HPV18) DNA 國際標(biāo)準(zhǔn)由冷凍干燥的重組質(zhì)粒 pBR322 含有通過其*的 EcoR1 位點(diǎn)克隆的全長 HPV18 DNA (Quint et al., 2006)
所屬分類:NIBSC標(biāo)準(zhǔn)品
更新時(shí)間:2022-04-21
廠商性質(zhì):經(jīng)銷商
品牌 | NIBSC | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè) |
1. 預(yù)期用途
用于核酸檢測的第一個(gè) HPV 18 型 (HPV18) DNA 國際標(biāo)準(zhǔn)由冷凍干燥的重組質(zhì)粒 pBR322 含有通過其*的 EcoR1 位點(diǎn)克隆的全長 HPV18 DNA (Quint et al., 2006)。 EcoR1 克隆位點(diǎn)位于 E1 基因內(nèi)。該標(biāo)準(zhǔn)已在純化的人類基因組 DNA 的背景下配制,以 0.5 ml 等分試樣凍干并在 -20 °C 下儲(chǔ)存。該材料在一項(xiàng)涉及 19 個(gè)實(shí)驗(yàn)室的國際合作研究中進(jìn)行了校準(zhǔn)(Wilkinson 等人,2010 年)。國際標(biāo)準(zhǔn)包含第三方專有的材料,應(yīng)僅用于內(nèi)部校準(zhǔn)或工作用于擴(kuò)增和檢測 HPV18 DNA 的標(biāo)準(zhǔn)。本國際標(biāo)準(zhǔn)不得用于任何其他目的,并且使用后應(yīng)丟棄。
2. 注意
NIBSC 06/206 人乳頭瘤病毒18 型標(biāo)準(zhǔn)品 不適用于人類或動(dòng)物人類食物鏈。
該材料含有源自 C33A 細(xì)胞的 DNA。和所有的一樣生物來源的材料,該制劑應(yīng)被視為對健康有潛在危害。它應(yīng)該被使用和丟棄根據(jù)您自己實(shí)驗(yàn)室的安全程序。這樣的安全程序應(yīng)包括戴防護(hù)手套和避免產(chǎn)生氣溶膠。應(yīng)注意在打開安瓿或小瓶,以避免割傷。
3. 單元
HPV18 DNA 的第一個(gè)國際標(biāo)準(zhǔn)(NIBSC 代碼 06/206)已被規(guī)定為每安瓿 5 x 10^6 國際單位 (IU) 的單位。
可追溯性聲明:
它是在 2008 年 1 月的 WHO 會(huì)議上提出的(Ferguson 等人,2009) HPV18 DNA 國際標(biāo)準(zhǔn)的使用說明包括用于確定用于制定國際標(biāo)準(zhǔn)的散裝材料的理論 HPV18 基因組當(dāng)量 (GEq) 的計(jì)算和假設(shè),從而證明 1 IU 相當(dāng)于 1 HPV18 DNA 的 GEq。因此,第一個(gè) WHO HPV18 DNA 國際標(biāo)準(zhǔn)的最終統(tǒng)一仍然是 IU,而可追溯性聲明將允許用戶將 IU 等同于 GEq。
在新墨西哥大學(xué) (UNM) 的 Cosette Wheeler 博士的實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行了重組 HPV18 質(zhì)粒儲(chǔ)備制劑的 DNA 濃度測定。 DNA濃度通過260 nm處的吸光度以及使用Picogreen測定法(Invitrogen Corporation,USA)的分光熒光法測定。在兩次 DNA 測量之間獲得了 0.95 或更高的相關(guān)系數(shù)。事先為了遞送至 NIBSC,將 HPV18 質(zhì)粒儲(chǔ)備制劑調(diào)整至 5 ng HPV18 質(zhì)粒 DNA/μl 的終濃度。 UNM 實(shí)驗(yàn)室還向 NIBSC 提供了一份聲明,表明 HPV18 的 1.0 x 1011 GEq/ml 等于 1.27 ng/μl。因此,5 ng HPV18 質(zhì)粒 DNA/ul 質(zhì)粒儲(chǔ)備液相當(dāng)于 3.937 x 1011 HPV18 GEq/ml。 NIBSC 使用這些數(shù)據(jù)制定了 HPV 18 型 DNA 的第一個(gè)國際標(biāo)準(zhǔn)。
為第 1 個(gè)國際標(biāo)準(zhǔn)制定散裝材料HPV 18 型 DNA(NIBSC 代碼 06/206):
在 NIBSC,大塊 HPV18 質(zhì)粒 DNA 材料是根據(jù)公式:
HPV GEq/ml 散裝材料 = (HPV GEq/ml 質(zhì)粒原液 x 體積質(zhì)粒原液)/體積散裝材料。因此,HPV18 GEq/ml 散裝材料 = (3.937 x 1011 HPV18 GEq/ml 質(zhì)粒原液) x (0.04826 ml HPV18 質(zhì)粒原液) / 1900 ml HPV18 散裝材料 = 1.0 x 107 HPV18 GEq/ml 散裝材料隨后將 HPV18 DNA 散裝材料以 0.5 ml 等分試樣冷凍干燥。
第一次將 IU 等同于 GEq 需要某些假設(shè)HPV18 DNA 國際標(biāo)準(zhǔn): 1) HPV18 的 1.0 x 1011 GEq/ml 等于 1.27 ng/μl; 2) 凍干后 HPV18 DNA 的活性沒有損失; 3)重組HPV18質(zhì)粒DNA準(zhǔn)確模擬了生物樣本中HPV18病毒DNA的活性。獨(dú)立計(jì)算重組 HPV18 質(zhì)粒的 GEq/ml脫氧核糖核酸。NIBSC 還使用 BioEdit 序列比對編輯器 v7.0.5.3 (Tom Hall, Isis 制藥公司,美國)。用于確定分子量的序列是 GenBankpBR322 的登錄號 J01749.1 和參考序列 HPV18(登錄 X05015)。
生物編輯數(shù)據(jù)DNA分子:HPV18登錄X05015
長度 = 7857 個(gè)堿基對
MW= 4763530.00 道爾頓,雙鏈
DNA分子:克隆載體pBR322
長度 = 4361 個(gè)堿基對
MW= 2653867.00 道爾頓,雙鏈
公式
根據(jù)以下公式計(jì)算 HPV 質(zhì)粒原液的 GEq/ml:
HPV 質(zhì)粒原液的 GEq/ml = (HPV 質(zhì)粒原液的 DNA 濃度) x (HPV DNA 的 MW + pBR322 的 MW)-1x (阿伏伽德羅數(shù)) 其中阿伏伽德羅數(shù) = 6.022x1023 分子/mol GEq/ml 大量 HPV DNA 材料根據(jù)以下公式計(jì)算:
HPV GEq/ml 散裝材料 = (HPV GEq/ml 質(zhì)粒原液 x 體積質(zhì)粒原液)/體積散裝材料。
計(jì)算
將重組 HPV18 質(zhì)粒原液提供給 NIBSC濃度為 5 ng/μl,因此 HPV18 質(zhì)粒的 GEq/ml庫存是:
= (5 x 10-9g/μl) x (mol/(7417397 g) x (6.022x1023 分子/mol)
= 4.059 x 108 分子/μl
= 4.0591 x 1011 分子/ml
= 4.059 x 1011
HPV18 GEq/ml
將 48.26μl 重組 HPV18 質(zhì)粒原液稀釋至終體積為 1900ml,因此:HPV18 GEq/ml 散裝材料 = (4.059 x 1011 HPV18 GEq/ml 質(zhì)粒原液) x (0.04826 ml HPV18 質(zhì)粒原液) / 1900 ml HPV18 散裝材料= 1.031 x 107 HPV18 GEq/ml 散裝材料
4. 內(nèi)容
生物材料原產(chǎn)國:英國。
每個(gè)安瓿含有 0.5 ml HPV18 質(zhì)粒 DNA 的凍干當(dāng)量,稀釋在 10 mM Tris 緩沖液 pH7.4 中,含有 1 mM EDTA、5 mg/ml 海藻糖和約 1 x 106 人 Geq/ml C33a 細(xì)胞。
5. 存儲(chǔ)
NIBSC 06/206 人乳頭瘤病毒18 型標(biāo)準(zhǔn)品 收到時(shí),安瓿瓶應(yīng)存放在 -20 °C 或以下。
請注意:由于凍干材料固有的穩(wěn)定性,NIBSC 可能會(huì)在環(huán)境溫度下運(yùn)輸這些材料。
6. 開瓶指南
DIN 安瓿瓶有一個(gè)“易開"顏色的壓力點(diǎn),窄的安瓿桿在此與較寬的安瓿瓶主體相連。各種類型的安瓿破碎機(jī)可商購獲得。要打開安瓿,輕輕敲擊安瓿以收集底部(標(biāo)記)末端的材料,然后按照安瓿隨附的制造商說明進(jìn)行操作
7. 材料的使用
在重新配制之前,不應(yīng)嘗試稱量凍干材料的任何部分。
HPV18 DNA 的第一個(gè)國際標(biāo)準(zhǔn)包含高拷貝數(shù)模板。 HPV18質(zhì)粒的風(fēng)險(xiǎn)很高,打開玻璃安瓿時(shí)通過霧化造成 DNA 污染。材料必須在單獨(dú)的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中打開和處理,遠(yuǎn)離試劑、實(shí)驗(yàn)室器具和樣品等其他預(yù)放大組件。該材料以凍干形式提供,使用前應(yīng)在 0.5 ml 無菌無核酸酶水中復(fù)溶。確保安瓿的內(nèi)表面被添加的水潤濕,以便重組粘附在玻璃上的任何凍干材料顆粒。重組材料的最終濃度為 1 X 10^7 IU/mL。
重組材料適用于校準(zhǔn)內(nèi)部或工作標(biāo)準(zhǔn),用于擴(kuò)增和檢測 HPV18 DNA(WHO/IVB/10.12)。該材料不應(yīng)用于校準(zhǔn)或評估提取、沉淀或離心程序。 NIBSC 可以為在提取步驟無法與擴(kuò)增步驟分離的分析中使用 06/206 提供指導(dǎo)(例如進(jìn)樣、應(yīng)答平臺(tái))。該材料尚未針對人類 DNA 核酸擴(kuò)增技術(shù)進(jìn)行校準(zhǔn)。